La méthodologie du projet « Pro-Electoral Integrity » s'appuie sur l'approche de soutien au cycle électoral de l'ECES et sur les cadres de référence de l'Union africaine en matière de diplomatie et de gouvernance démocratique. Le projet adopte une méthodologie multidimensionnelle et sensible aux conflits qui combine le renforcement institutionnel, l'apprentissage par les pairs, l'assistance technique en matière électorale, le développement des capacités et le dialogue politique afin de promouvoir l'intégrité électorale et la résilience démocratique dans toute l'Afrique.

Le projet est mis en œuvre dans le cadre d'un partenariat entre le Département des affaires politiques, de la paix et de la sécurité de la Commission de l'Union africaine (AUC-PAPS) et l'ECES, au titre du protocole d'accord de 2021, qui met l'accent sur la promotion de l'intégrité électorale, la prévention de la violence électorale, le renforcement des droits de l'homme et l'amélioration de la participation politique des femmes et des groupes vulnérables.

D'un point de vue méthodologique, le projet s'articule autour de deux domaines de résultats interdépendants : la prévention des conflits et la consolidation de la paix après les conflits. Au sein de ces domaines, l'intervention combine des actions préventives, un accompagnement institutionnel et une consolidation démocratique à long terme.

Un élément méthodologique central du projet est l'échange institutionnel entre pairs au sein des organismes de gestion électorale africains (OGE). Dans le cadre de missions d’apprentissage entre pairs et d’échanges organisées en collaboration avec l’Association des autorités électorales africaines (AAEA), les présidents des OGE et les hauts fonctionnaires électoraux sont envoyés dans les pays où se tiennent des élections afin d’échanger des expériences, de fournir des conseils techniques, de partager des pratiques comparatives et de soutenir les institutions homologues pendant les périodes électorales sensibles. Ces missions sont conçues non seulement comme des exercices d’observation, mais aussi comme des mécanismes de solidarité et de résilience institutionnelle qui renforcent les normes continentales communes en matière d’intégrité électorale.

La méthodologie met également l’accent sur l’apprentissage adaptatif et les mécanismes de retour d’information institutionnel. Le projet prévoit des processus systématiques de révision et de suivi visant à tirer les enseignements des échanges entre pairs et à affiner au fil du temps la méthodologie d’apprentissage par les pairs de l’UA. Cela permet au projet de rester flexible et réactif face à l’évolution des contextes politiques et électoraux à travers le continent.

Un autre pilier méthodologique fondamental est l’assistance technique sur mesure destinée aux organismes de gestion électorale. Les experts de l’ECES et de l’UA organisent des missions techniques à court terme adaptées aux besoins opérationnels d’ s spécifiques d’organismes de gestion électorale avant les périodes électorales. Ces missions apportent une expertise spécialisée dans des domaines tels que les opérations électorales, la communication électorale, la veille médiatique, l’analyse des réseaux sociaux, la cybersécurité, les applications de l’intelligence artificielle aux élections et la prévention des conflits électoraux. Ce soutien est adapté aux contextes nationaux et mis en œuvre en étroite collaboration avec le personnel des OGE afin de garantir l’appropriation institutionnelle et la durabilité.

En outre, le projet utilise l'intégration éducative et réglementaire comme méthodologie pour la consolidation démocratique à long terme. Par le biais de l’initiative sur les programmes scolaires de la Charte africaine de la démocratie, des élections et de la gouvernance (ACDEG), le projet soutient l’élaboration et l’expérimentation de supports pédagogiques dans toutes les régions africaines afin d’institutionnaliser les valeurs démocratiques, le constitutionnalisme, les principes de l’État de droit et l’éducation civique au sein des systèmes éducatifs nationaux.

Le projet intègre également des méthodologies fondées sur le dialogue et la participation à travers des forums continentaux, des dialogues de haut niveau et des plateformes de coopération régionale impliquant les institutions de l’Union africaine, les communautés économiques régionales, la société civile, les jeunes, les femmes et les parties prenantes du domaine électoral. Ces activités visent à promouvoir l’appropriation collective des normes démocratiques et à renforcer la coopération régionale en matière de gouvernance électorale et de prévention des conflits.

Enfin, la méthodologie s'inscrit pleinement dans le principe de l'UA visant à promouvoir les compétences pilotées par l'Afrique, l'appropriation régionale et la coopération intra-africaine en matière de gouvernance électorale. L'ECES soutient ce processus à travers sa méthodologie EURECS (« European Response to Electoral Cycle Support »), qui met l'accent sur l'appui au cycle électoral, le développement du leadership, les échanges entre pairs, la médiation et la prévention des conflits électoraux.